次世代シーケンサーアグリバイオの分野は、ヒトやマウスといった ゲノム配列既知のモデル生物ではなく アノテーション情報が乏しい 非モデル生物を主に取り扱います。 例えば、主に次世代シーケンサーから 得られるRNA-seqデータを用いて、 「de novo assemblyを行い、発現変動領域を同定する」 といった解析が第一段階として行われます。 アセンブル周辺は未だにLinux上でのみ 動作するプログラムを利用するしかありません ♪
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